Οι λιμνοθάλασσες είναι εκτάσεις ρηχών παράκτιων θαλασσινών υδάτων, ποικίλης αλατότητας και όγκου νερού, που διαχωρίζονται πλήρως ή εν μέρει από τη θάλασσα από όχθες άμμου ή βότσαλα ή, λιγότερο συχνά, από βράχια. Η αλατότητα μπορεί να ποικίλλει από υφάλμυρο νερό έως υπεραισθησία ανάλογα με τις βροχοπτώσεις, την εξάτμιση και την προσθήκη φρέσκου θαλασσινού νερού από καταιγίδες, προσωρινές πλημμύρες της θάλασσας το χειμώνα ή παλιρροιακή ανταλλαγή. Με ή χωρίς βλάστηση από Ruppietea maritimae, Potametea, Zosteretea ή Charetea (CORINE91: 23.21 ή 23.22).

Οι αλμυρές λεκάνες και οι αλμυρές λίμνες μπορούν επίσης να θεωρηθούν ως λιμνοθάλασσες, υπό την προϋπόθεση ότι είχαν την προέλευσή τους σε μια φυσική παλιά λιμνοθάλασσα ή σε αλμυρό βάλτο και χαρακτηρίζονται από μικρή επίδραση από ανθρώπινη εκμετάλλευση.

Coastal Lagoons, falling into the category: Coastal and Halophytic Habitats

Lagoons are expanses of shallow coastal salt water, of varying salinity and water volume, wholly or partially separated from the sea by sand banks or shingle, or, less frequently, by rocks. Salinity may vary from brackish water to hypersalinity depending on rainfall, evaporation and through the addition of fresh seawater from storms, temporary flooding of the sea in winter or tidal exchange. With or without vegetation from Ruppietea maritimae, Potametea, Zosteretea or Charetea (CORINE91: 23.21 or 23.22).

Flads and gloes, considered a Baltic variety of lagoons, are small, usually shallow, more or less delimited water bodies still connected to the sea or have been cut off from the sea very recently by land upheaval. Characterised by well-developed reedbeds and luxuriant submerged vegetation and having several morphological and botanical development stages in the process whereby sea becomes land.

Salt basins and salt ponds may also be considered as lagoons, providing they had their origin on a transformed natural old lagoon or on a saltmarsh, and are characterised by a minor impact from exploitation.